新疆医科大学第二附属医院骨科创建于1956年。作为北京大学、上海同济大学、中南大学的长期受援单位，自2008年迄今已有七位国内知名专家在来院开展援疆工作。于1999年经自治区卫生厅批准成立了“新疆骨关节疾病及周围神经损伤诊治中心”。2015年获批国家级住院医师规范化培训骨科基地，2016年获自治区重点专科支持。现设三个科室，编制床位75张。共有医护人员37名，主任医师4名，副主任医师3名，博士生导师1名，硕士研究生导师4名。

科室设置创伤、脊柱、关节、运动医学、显微外科、儿童骨科等亚专业。目前已成熟开展了髋、膝、踝及肩肘关节置换手术，颈椎病、椎间盘疾病、脊椎肿瘤、脊柱结核手术治疗，脊柱退变性疾病如腰椎间盘突出、腰椎滑脱、腰椎管狭窄症、颈椎病的微创脊柱全内镜下手术治疗；脊柱骨折微创手术治疗；骨盆骨折微创接骨术、四肢骨折微创复位固定、髓内钉技术，关节镜下膝交叉韧带重建术、肩袖损伤修复、重建等系列微创手术治疗，各种带蒂、游离组织瓣移植，断肢、断指再植等显微手术。

检查和治疗仪器设备：飞利浦C臂机、美国GE C臂机、手外科显微镜、美国Smith&nephew关节镜、Joimax椎间孔镜、贝斯大通道脊柱内镜、骨科可透视手术床牵引床、GE双能骨密度仪。拥有术后冷疗系统、冲击波、超声波、深部肌肉刺激仪等康复设施及专业肌骨康复治疗师。围术期多模式镇痛及术后早期康复治疗使患者拥有良好的就医体验。