神经内科临床诊疗中心为国家级临床重点专科、新疆医科大学支撑学科、新疆医科大学第二附属医院重点学科。目前共设5个病区：神经内科一病区（脑血管病与感染）、神经内科二病区（癫痫与肌病）、神经内科三病区（运动障碍性疾病、睡眠中心和神经调控中心）、神经内科四病区（痴呆与神经免疫）、神经内科五病区（中西医结合脑病），床位达170张。拥有一批临床经验丰富、诊疗水平高超的专家，享受国务院特殊津贴、自治区突出贡献优秀专家1人，“双聘教授”、自治区高层次人才1人、长江学者1人，天山英才2人，援疆干部人才2人，博导5人（其中4

神经外科临床诊疗中心为自治区级临床重点专科，新疆医科大学支撑学科，新疆医科大学第二附属医院重点学科，国家卫健委能力建设和继续教育中心认定的神经外科建设中心，国家民政部指定全国第四家、西北地区唯一一家“明天计划”脑瘫手术和康复治疗中心，于2021年建立了院级癫痫中心、神经内镜中心。目前设四个病区：神经外科一病区（神经肿瘤）、神经外科二病区（脑血管病）、神经外科三病区（神经介入及功能），神经外科四病区（脑瘫手术与康复中心），编制床位130张。中心有享受国务院特殊津贴、自治区突出贡献优秀专家1人，天山英才2人。

医学影像中心作为自治区临床重点专科、自治区重点学科，拥有技术全面、结构合理的专业人才队伍，团队现有医务人员28名，主任医师2名、副主任医师4名、主治医师7名、主管技师4名，主管护师3名、初级医师8名。近三年《基干影像组学的颅内动脉粥样硬化性高危斑块识别及其卒中发病机制的研究》团队在三维高分辨磁共振管壁成像相关工作中积累的大量经验，以颅内动脉粥样硬化一级预防及二级预防的患者为研究对象，采用影像组学的分析方法，识别高危斑块影像组学特征，以期建立一站式、精准化、个体化的诊断、治疗决策体系，最终提高一级预防及二级

康复医学科为自治区临床重点专科，现有博士1人，硕士7人，副主任医师1人，副主任技师1人，主治医师3人。现有医师10人，技师25人，护士7人。核定床位23张。已形成神经（重症）康复、骨科康复、儿童康复、老年病慢性病康复等特色康复亚专业。开设康复病区、治疗项目完善的成人和儿童康复治疗区、康复门诊及康复评定室。在脑卒中、脊髓损伤、脑性瘫痪、帕金森病等神经系统病损的康复治疗；骨折、髋膝关节置换术术后，颈椎病、腰椎间盘突出症、肌筋膜炎等慢性肌肉骨骼疼痛性疾病的康复治疗上有专科优势。已开展球囊扩张术改善吞咽功能障碍、

运动医学科为自治区临床重点专科，创建于1956年。作为北京大学、上海同济大学、中南大学的长期受援单位，自2008年迄今已有九位国内知名专家来院开展援疆工作，长期担任名誉主任。于1999年经自治区卫生厅批准成立了“新疆骨关节疾病及周围神经损伤诊治中心”。2015年获批国家级住院医师规范化培训骨科基地，2016年获自治区临床重点专科（运动医学）支持。现设三个病区，编制床位65张。共有医护人员26名，主任医师4名，副主任医师4名，硕士研究生导师4名（含援疆专家）。科室设置创伤、脊柱、关节、运动医学、显微修复外科

心胸外科组建于上世纪五十年代建院初期，有60多年的历史，是自治区临床重点专科。由同一技术队伍承担着胸外科、心外科两个专业的临床工作，2014年经自治区批准为我院第一批自治区重点专科。亚专科技术水平方面已形成特色，技术能力强，人员构成合理，编制床位18张，有主任医师2人，副主任医师2人，主治医师3人，优势病种如：胸部创伤、纵膈疾病、肺疾病、食管疾病等微创手术治疗达到了国内先进水平，先心病微创介入治疗、冠脉搭桥手术、心脏瓣膜置换手术、动脉夹层介入治疗等在疆内具有明显优势，学术成果：国家级自然科学基金项目1项，