新医大二附院心胸外科成立于上世纪五十年代，距今约六十年。它以胸外科为主，同时兼顾心脏外科学为专业方向，是自治区较早开展心胸外科手术及综合治疗专业科室之一。

在学科发展及建设过程中主要以：肺疾病、食管疾病，纵膈疾病、先天性心脏病、心脏瓣膜疾病、冠心病、心脏大血管疾病的外科治疗为主，尤其是近几年来全面开展腔镜下微创治疗取得了全疆乃至全国同步。同时进行胸部恶性肿瘤的化疗、介入治疗、生物靶向治疗等，积极开展肿瘤多学科治疗（MDT）模式。

目前心胸专业主任医师3名，副主任医师1名，主治医师3名，住院医师1名，其中博士生导师1名，硕士4名。科室现设置床位18张，近几年科室心专业胸微创手术发展加快，年手术量达到200余台。