运动医学科为自治区临床重点专科，创建于1956年。作为北京大学、上海同济大学、中南大学的长期受援单位，自2008年迄今已有九位国内知名专家来院开展援疆工作，长期担任名誉主任。于1999年经自治区卫生厅批准成立了“新疆骨关节疾病及周围神经损伤诊治中心”。2015年获批国家级住院医师规范化培训骨科基地，2016年获自治区临床重点专科（运动医学）支持。现设三个病区，编制床位65张。共有医护人员26名，主任医师4名，副主任医师4名，硕士研究生导师4名（含援疆专家）。科室设置创伤、脊柱、关节、运动医学、显微修复外科等亚专业。主持省部级科研项目2项，中华医学会课题及厅局级课题各1项，自治区重点实验室开放课题1项，新疆医科大学科研创新基金1项，自治区自然科学基金1项；参与国家自然科学基金项目2项，自治区自然科学基金项目2项，省级课题4项，厅级课题2项，校级课题3项；指导并参与自治区卫健委青年创新基金1项、新疆医科大学科研创新基金3项；发表相关学术论文52余篇，其中SCI及核心期刊16篇，实用新型专利3项。